Organem decyzyjnym ERRS jest Rada Generalna, której przewodniczy prezes EBC Christine Lagarde. Rada omawia aktualną sytuację makroostrożnościową i w razie potrzeby wydaje zalecenia lub ostrzeżenia.
Komitet Sterujący uczestniczy w przygotowaniu posiedzeń Rady Generalnej. Ocenia analizy przedstawiane przez organy pomocnicze (Doradczy Komitet Naukowy i Doradczy Komitet Techniczny) oraz omawia plan działań makroostrożnościowych ERRS.
Doradczy Komitet Techniczny udziela Europejskiej Radzie ds. Ryzyka Systemowego porad i wsparcia w kwestiach związanych z jej działalnością.
Doradczy Komitet Naukowy prowadzi badania, które dostarczają Radzie Generalnej informacji potrzebnych do podejmowania decyzji makroostrożnościowych. Regularnie publikuje sprawozdania ze swoich prac. Wydaje także cykl artykułów naukowych Working Paper Series oraz przyznaje Nagrodę im. Ieke van den Burg.
Sekretariat organizuje bieżącą działalność ERRS, zapewniając jej komitetom wsparcie administracyjne, analityczne i statystyczne.