O Conselho Geral, liderado pela Presidente do BCE, Christine Lagarde, é o órgão de decisão do CERS. Tem como funções debater a evolução macroprudencial atual e, quando necessário, formular recomendações e emitir alertas.
O Comité Diretor assiste na organização das reuniões do Conselho Geral. Revê as análises apresentadas pelos órgãos consultivos do CERS (o Comité Técnico Consultivo e o Comité Científico Consultivo) e discute a agenda de políticas macroprudenciais do CERS.
O Comité Técnico Consultivo presta aconselhamento e assistência em questões relevantes para o trabalho do CERS.
O Comité Científico Consultivo realiza estudos, que servem de base às decisões macroprudenciais do Conselho Geral. Os resultados são publicados regularmente nos relatórios do comité. O comité é ainda responsável pela Série de Documentos de Trabalho do CERS e pelo Prémio de Investigação Ieke van den Burg.
O Secretariado é responsável pela atividade diária do CERS. Proporciona apoio administrativo, analítico e estatístico aos comités do CERS.